Em uma festa de homenagem á Mistério Sociedade Anônima, eles são convidados a uma exposição de todos os disfarçes dos vilões derrotados por Fred, Daphne, Velma, Scooby e Salsicha. Mas após um ataque inesperado do fantasma do pterodáctilo, Scooby e sua turma vão enfrentar um desconhecido vilão mascarado que planeja dominar a cidade de Coolsvile, usando uma máquina criadora de monstros, alguns são vilões conhecidos do desenho animado, como o Fantasma do Pterodáctilo, Capitão Cutler, o Cavaleiro Negro, os Homens-Esqueleto, o Monstro de Alcatrão e o Fantasma dos 10.000 Volts.